Odată cu venirea noului mileniu Francis Ford Coppola Și-a lăsat munca în spatele camerelor foarte izolat și s-a dedicat producției, în special celei a filmelor fiicei sale, Sofia Coppola.
Deja în 1999, a produs debutul fiicei sale în spatele camerelor „The suicidal virgins”, un film cu care Sofia coppola Ea a devenit cunoscută ca o mare regizoră, iar asta i-ar deschide porțile pentru a putea filma alte producții.
Tot în acel an, Francis Ford Coppola a produs filmul „Sleepy Hollow”, un film regizat de Tim Burton și cu rol principal în Johnny Depp și Christina Ricci.
În 2001 a produs „CQ”, un film al fiului său Coppola romanăLa fel ca și sora lui, Roman este produs și de tatăl său în primul său lungmetraj.
În 2006 s-a întors să producă un film pentru fiica sa Sofia, în acest caz al treilea din filmografia sa "Maria Antoaneta".
Primul film pe care Francis Ford Coppola l-a realizat în secolul XXI a venit abia în 2007. Este vorba despre „Tineret fără Tineret”. La zece ani de la filmarea „Legitimate Defense”, se întoarce în spatele camerei pentru a filma acest film aproape experimental, filmat în România și la un cost foarte mic, filmul a fost o reciclare a lui Coppola ca regizor.
Filmul povestește viața unui bărbat care trebuie să fugă de naziști, care vrea să experimenteze cu el, deoarece după un fulger începe să se întinerească.
La doi ani după „Tinerețe fără tinerețe”, Coppola revine cu un alt proiect intim, «tetra«. În acest caz, s-a mutat în Argentina pentru a vorbi despre imigrația italiană care a ajuns acolo la începutul secolului XX.
O distribuție cu Vincent Gallo, Maribel Verdú, Klaus Maria Brandauer și Carmen Maura printre alți interpreți.