Con la llegada del nuevo milenio Francis Ford Coppola ha dejado muy apartada su labor tras las cámaras y se ha dedicado a la producción, especialmente a la de las películas de su hija Sofia Coppola.
Ya en 1999, produjo el debut de su hija tras las cámaras “Las vírgenes suicidas”, cinta con la que Sofia Coppola se dio a conocer como una gran realizadora, y que le abriría las puertas a poder rodar otras producciones.
También ese año Francis Ford Coppola produce la cinta “Sleepy Hollow”, cinta que dirigió Tim Burton y protagonizaron Johnny Depp y Christina Ricci.
En el año 2001 produjo “CQ”, filme de su hijo Roman Coppola, al igual que a su hermana, a Roman también le produce su padre su ópera prima.
En 2006 vuelve a producirle una película a su hija Sofia, en este caso la tercera de su filmografía “María Antonieta”.
La primera película que rodó Francis Ford Coppola en el siglo XXI no llegó hasta 2007. Se trata de “Youth without Youth”. Diez años después de que rodará “Legítima defensa” vuelve a ponerse tras la cámara para rodar este film casi experimental, rodado en Rumania y con muy bajo coste, el film suponía un reciclaje de Coppola como cineasta.
El film narra la vida de un hombre que ha de huir de los nazis, los cuales quieren experimentar con él, ya que tras caerle un rayo comienza a rejuvenecer.
Dos años después de “Youth without youth”, Coppola vuelve con otro íntimo proyecto, «Tetro«. En este caso se traslada a Argentina para hablar sobre la inmigración italiana llegada allí a principios del siglo XX.
Un reparto con Vincent Gallo, Maribel Verdú, Klaus Maria Brandauer y Carmen Maura entre otros intérpretes.