Aktor David Duchovny telah mengakui bahwa akan ada bagian ketiga dari kisah "X Files" di bioskop:
“Sedang dalam proses penulisan. Kami hanya menunggu lampu hijau dari Fox, sedikit kecewa dengan penerimaan yang relatif buruk untuk film kedua. Kesalahannya datang, menurut saya, karena mereka menyimpang terlalu jauh dari akar seri. Selanjutnya, film ini dirilis pada musim panas. Yang ketiga akan jauh lebih dekat dari yang diharapkan publik, dengan konspirasi pemerintah, dll. "
Jika bagian pertama menghibur bagian kedua dari "The X Files" itu adalah kegagalan kritis dan publik sehingga tidak mengherankan bahwa Fox berpikir untuk memproduksi bagian ketiga dari kisah ini.